民間科學不等於偽科學

自然國學對於現代科技的影響隻是其中的一方面，現實中對於自然國學的討論更多的是質疑之聲。清華大學國學研究院院長、中國哲學史學會會長陳來在談到自然國學存在的問題時說，比如現在社會上流行的國學班，可能會學《論語》、《孟子》，但肯定不會學《九章算術》。“這從一個側面說明瞭，相比於人文方面，自然國學在現實中的地位比較低。”

民間科學不等於偽科學

除瞭自然國學本身的地位低，在日常生活中自然國學尤其是中醫引起的爭議也非常大，這其中，最為出名的是打通任督二脈之說。

2012年5月23日，甘肅衛生廳稱，41名甘肅醫務人員打通瞭任督二脈。甘肅省衛生廳廳長劉維忠稱打通任督二脈可令身體更健康。此事件隨後引起社會熱議。2012年5月31日，衛生部新聞發言人作出回應，對甘肅醫務人員打通“任督二脈”一事表示，甘肅舉行培訓班，目的是使醫務人員瞭解和掌握更多的中醫知識和方法。同時，在學術層面，國傢鼓勵開展學術爭鳴。

而太極推手閆芳的隔空打人做法則在一定程度上使得自然國學在大眾心目中成瞭忽悠之學。2012年10月10日，因“隔空打人”受熱議的閆芳被李經梧後人開除山門，“隔空打人”也被定性為偽科學。